Jurnal Iktiologi Indonesia (JII) adalah jurnal ilmiah biannual yang diterbitkan oleh Masyarakat Iktiologi Indonesia (MII) pada bulan Juni dan Desember. JII menyajikan makalah yang berkenaan dengan segala aspek kehidupan ikan (Pisces) di perairan tawar, payau, dan laut. Aspek yang dicakup antara lain biologi, fisiologi, dan ekologi, serta terapannya dalam bidang penangkapan, akuakultur, pengelolaan perikanan, dan konservasi. Artikel dapat berupa hasil penelitian, rangkuman suatu topik, ulasan singkat, ataupun resensi buku.
Jurnal Iktiologi Indonesia (JII) ditetapkan sebagai Berkala Ilmiah terakreditasi berdasarkan Surat Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Nomor 64a/DIKTI/Kep/2010 tentang Hasil Akreditasi Berkala Ilmiah (Periode II Tahun 2010) berlaku hingga November 2013. Jurnal Iktiologi Indonesia (JII) kembali menerima penghormatan dan kepercayaan sebagai Berkala Ilmiah Terakreditasi Nasional berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia Nomor 040/P/2014 tanggal 14 Februari 2014. Hasil Akreditasi Terbitan Berkala Ilmiah Periode II Tahun 2013 ini menegaskan bahwa Jurnal Iktiologi Indonesia merupakan salah satu berkala ilmiah terakreditasi nasional terhitung dari November 2013 sampai dengan November 2018.